Vesijäähdytteisen jäähdyttimen lämmönpoistokyky on suoraan verrannollinen jäähdytysnesteen (veden tai muun nesteen) virtausnopeuteen, ja kylmäainenesteen virtausnopeus on suhteessa jäähdytysjärjestelmän vesipumpun tehoon. Lisäksi veden lämpökapasiteetti on suuri, minkä ansiosta vesijäähdytteisellä jäähdytysjärjestelmällä on hyvä lämpökuormituskyky. Se vastaa 5 kertaa ilmajäähdytteistä järjestelmää, ja suora hyöty on, että suorittimen käyttölämpötilakäyrä on erittäin tasainen. Esimerkiksi ilmajäähdytteistä patteria käyttävä järjestelmä kokee lämpötilapiikin lyhyessä ajassa, kun ohjelmaa suoritetaan raskaalla suorittimen kuormituksella, tai se voi ylittää prosessorin varoituslämpötilan. Vesijäähdytteisessä lämmönpoistojärjestelmässä on kuitenkin suhteellisen pienet lämpövaihtelut sen suuren lämpökapasiteetin vuoksi. Paljon enemmän.
Vesijäähdytyksen lämmönpoistoperiaatteiden näkökulmasta se voidaan jakaa kahteen kategoriaan: aktiivinen vesijäähdytys ja passiivinen vesijäähdytys. Sen lisäksi, että aktiivisessa vesijäähdytyksessä on kaikki vesijäähdytyspatterin lisävarusteet, siihen on asennettava myös jäähdytystuuletin, joka auttaa lämmönpoistossa, mikä voi parantaa huomattavasti lämmönpoistovaikutusta.
Passiivinen vesijäähdytys ei asenna jäähdytyspuhaltimia ja luottaa vain itse vesijäähdytyspatteriin lämmönpoistoon. Korkeintaan lisätään joitain jäähdytyselementtejä auttamaan lämmön haihtumista. Tämä vesijäähdytysmenetelmä on vähemmän tehokas kuin aktiivinen vesijäähdytys, mutta sillä voidaan saavuttaa täysin äänetön vaikutus.
Korkea lämpötila ei ainoastaan aiheuta järjestelmän epävakaata toimintaa, lyhentää sen käyttöikää, vaan saattaa jopa aiheuttaa joidenkin osien palamisen. Lämpöä, joka aiheuttaa korkeita lämpötiloja, ei tule tietokoneen ulkopuolelta, vaan tietokoneen sisältä. Lämpöpatterin tehtävänä on imeä tämä lämpö ja varmistaa, että tietokoneen osien lämpötila on normaali. Patterityyppejä on monenlaisia. Prosessorit, näytönohjaimet, emolevyn piirisarjat, kiintolevyt, runko, virtalähteet ja jopa optiset asemat ja muisti vaativat kaikki säteilijät. Näitä eri säteilijöitä ei voi sekoittaa, ja yleisin on CPU-säteilijä. . Jaetut lämmönpoistomenetelmät voidaan jakaa ilmajäähdytykseen, lämpöputkiin, vesijäähdytykseen, puolijohdejäähdytykseen, kompressorijäähdytykseen jne.